菇類(mushroom)是一種真菌(fungus)。「真菌」是台灣(Taiwan)常用的學術名詞，也稱為：菌類、黴菌或菌物。真菌的種類很多，菇類是屬於高等真菌或大型真菌(macrofungus)。大型真菌擁有碩大的子實體(fruiting body)，也就是真菌的果實，俗名稱為菇。擔子菌(bsidiomycetes)的子實體稱之為擔子果(basidiocarp)，子囊菌(ascomycetes)子實體叫做子囊果(ascocarp)。菇類在中文古書中也稱為：菌、蘑、蕈、芝、菰、露、耳、草、苓、茸等。
市面上常見的菇類多半是屬於真菌的擔子菌群 (Basidiomycota)，例如洋菇(common mushroom)等。少部份菇類是屬於子囊菌群(Ascomycota)，例如松露(truffle)等。許多真菌的子實體很小不適合採擷當作食物。這些是低等真菌(lower fungus)，例如瓶菌群(Chytridiomycota)的水黴菌(water mold)等，以及接合菌群(Zygomycota)的麵包黴菌(bread mold)等。
依照生物學的分類方法，真菌從低等到高等可以分為以下四大類：
(1) 瓶菌群 (低等真菌)：例如水黴菌。
(2) 接合菌群 (低等真菌)：例如麵包黴。
(3) 子囊菌群 (高等真菌，菇類)：例如松露。
(4) 擔子菌群 (高等真菌，菇類)：例如洋菇。